Podłożem schorzenia są genetycznie uwarunkowane zaburzenia mechanizmów regulacyjnych prowadzących do nadprodukcji przeciwciał klasy ige. atopowe zapalenie skóry przeciwciała te są skierowane głównie przeciwko alergenom żywnościowym i powietrzno pochodnym. azs charakteryzuje się różnie nasiloną jałowością i wrażliwością skóry ongiś oznaczano to zjawisko „ brakiem ektodermalnym”.
u jej podłoża leży zwiększona przez naskórkowa utrata wody (tewl) związana z zaburzeniami tworzenia się osłonki lipidowej korneocytów, a także obniżenie pułapu ceramidów i zaburzenia syntezy lipidów powłoce rogowatej. skutkiem przedstawionych zjawisk jest zniszczenie bariery naskórkowej, jaka staje się bardziej narażona na psotne działanie alergenów, czynników męczących. w proces chorobowy jest także zaangażowany układ neurohormonalny. pod wpływem różnych czynników stres, stan zapalny wyzwolone są różne neuropeptydy (endorfina, acetylocholina, vip, sp. cgrp), jakie potrafią wzmagać czułość na histaminę.